In het slot van seizoen vijf van Endeavour ging het professionele leven van het titelpersonage volledig op zijn kop. Zijn politiebureau ging dicht vanwege een reorganisatie en de jonge Morse (Shaun Evans) moet nu zonder zijn oude maat Thursday op boevenjacht: het duo is geplaatst op verschillende bureaus.
Verdwenen meisjes
De eerste zaak van seizoen zes brengt hen toch weer samen: Morse vindt het stoffelijk overschot van een jong meisje in een weiland. Hij verdenkt een drugsverslaafde die in de buurt is gezien, en Thursdays nieuwe partner Ronnie Box is het met hem eens. Morse komt er echter al snel achter dat er ook nog andere verdachten zijn, iets wat Box (Simon Harrison) snel wegwuift. De zaak komt in een stroomversnelling als er een ander meisje verdwijnt.